近年、養殖業で広く研究されているプロバイオティクスには、乳酸菌や枯草菌などがある。これらのプロバイオティクスには、水生動物の腸内細菌叢の構成を改善し、腸内細菌叢のバランスを調整する能力があり、これは主に、プロバイオティクスを摂取した後の水生動物の腸内の有益細菌の増加と病原細菌の減少に反映されている。同時に、プロバイオティクスが水生動物の免疫系に与える影響を探るために、リゾチーム（LZM）、スーパーオキシドディスムターゼ（SOD）、酸性ホスファターゼ（ACP）、アルカリホスファターゼ（AKP）、一酸化窒素合成酵素（NOS）などの非特異的免疫指標に対するプロバイオティクスの影響を調査する研究が多数行われている。
水生動物の腸内細菌叢に対する乳酸菌の影響
水生動物の乳酸菌には、主にラクトバチルス・アシドフィルス、エンテロコッカス・フェカリス、ラクトバチルス・ラムノサスなどがある。尹俊霞らの研究によると、フナでは乳酸菌とビフィズス菌の両方が正常な腸内細菌叢であることがわかった。フナにプロバイオティクス製剤を与えると、腸内好気性細菌の数は大幅に減少し、乳酸菌の数は大幅に増加した。この結果は、乳酸菌がフナの腸内に定着し、腸内細菌叢の構成を効果的に改善できることを示しています。同様に、ラクトバチルス・アシドフィルスも、オレオクロミス・ニロティクス（GIFT）の腸内における大腸菌の増殖をある程度抑制し、SOD、ACP、AKPなどの非特異的免疫指標を増加させることで、体の免疫力を高めることができます。 Zhou Xiaobo らは、ティラピアの飼料に Enterococcus faecalis を加えたところ、Lactobacillus acidophilus を与えた場合と同様の実験結果を示しました。ティラピアの腸内の乳酸菌の数は大幅に増加し、Escherichia coli の数は減少しました。これは、飼料に乳酸菌を添加すると、腸内の有益菌の増殖を促進し、有害菌の増殖を抑制し、腸内細菌叢のバランスを調整し、腸内微小環境を改善できることを示しています。Pirarat らは、ナイルティラピア (Oreochromis niloticus) に Lactobacillus rhamnosus を添加剤として混ぜて与えたところ、腸絨毛の高さ、上皮内のリンパ球の数、腸内プロバイオティクスの数が大幅に増加し、腸の免疫機能をある程度高めることができることを発見しました。Nikoskelainen らは、Lactobacillus rhamnosus を添加物として混ぜて与えたところ、腸の絨毛の高さ、上皮内のリンパ球の数、腸内プロバイオティクスの数が大幅に増加し、腸の免疫機能をある程度高めることができることを発見しました。飼料レベル105 CFU/gのラクトバチルス・ラムノサス（ATCC53103）は、ニジマスの腸内細菌叢のバランスを効果的に調節し、腸内の乳酸菌やビフィズス菌などのプロバイオティクスの数を増やし、一部の水生病原体を効果的に抑制できることが分かりました。
水生動物の腸内細菌叢に対する枯草菌の影響
乳酸菌に加えて、枯草菌も水生動物でよく使用されるプロバイオティクスです。Li Guiyingらは、それぞれ2011年と2013年にバチルス・フィルムスを添加した飼料をバナメイエビに与えました。その結果、飼料にプロバイオティクスを添加すると、バナメイエビの腸管内の消化酵素の活性が高まり、腸内細菌叢の数を正に制御し、優勢な腸内細菌叢と総細菌数の増加につながることが示されました。同時に、血清中のSOD、ACP、AKP、NOSなどの非特異的免疫指標も増加しました。Zhou Huihuiらは、Apostichopus japonicusの腸管からプロバイオティクスを分離し、BacillusとEnterococcus faecalisであると特定しました。腸内のビブリオ菌の数は相対的に減少し、プロバイオティクスの数が増加したことを発見した。ナマコの血清中のLZM、SOD、ACPなどの免疫酵素指標の増加は、プロバイオティクスが病原細菌の増殖を抑制し、水生動物に定着することで、体の免疫力を高めることができることを示している。Sun Shengmingらは、稚魚のアカウミガメの餌に枯草菌を加えたところ、成長性能と抗酸化能力が向上したことを発見した。腸内微生物叢構造の多様性が大幅に減少し、腸内微生物叢構造に大きな変化が生じた。Liu Boらは、同種異系のハクレンに枯草菌を与えた後、プロバイオティクスの摂取量が増加した。その結果、バチルスや乳酸菌などのプロバイオティクスの数が著しく増加し、大腸菌やサルモネラなどの病原菌が付着して定着しなくなり、腸内細菌叢のバランスが効果的に維持されることがわかった。Tang Yangらも、バチルス・セレウスを飼料に混ぜてバナメイエビに与えると、エビの腸内細菌叢の組成が変化し、腸内のビブリオの数を減らすことができるという同様の結論に達した。
複合プロバイオティクスが水生動物の腸内細菌叢に与える影響
近年、複合型プロバイオティクスの応用が増加しています。複合型プロバイオティクスを飼料に添加すると、単一のプロバイオティクスを添加する場合と比較して、水生動物の腸内細菌数の減少、腸内微生物叢のバランスの調整、腸内微生物叢の構成の改善に対する促進効果がより優れています。He Weicong らによる研究では、Bacillus subtilis と Lactobacillus acidophilus の複合型プロバイオティクスを継続的に給餌すると、Rachycentron canadum の腸内微生物叢の構成と量が大幅に改善されることがわかっています。Bacillus subtilis は好気性細菌で、腸内に入った後に大量の酸素を消費するため、嫌気性 Lactobacillus acidophilus が腸内で成長して繁殖するのに有利です。増殖の過程で両者は協力し合い、腸内微生物叢の動的バランスを維持します。Hu Yi ららはバナメイエビを研究し、バチルス・サチリス単独および複合バチルスを補充した飼料を与えた。彼らは、複合プロバイオティクスがバナメイエビの腸内細菌叢の構成を改善するのに優れた効果を持つことを発見した。飼料にプロバイオティクスを添加すると、腸内のアーク細菌の数が大幅に減少し、それによって腸内細菌叢のバランスが維持された。Pan Leiらも、単独および複合プロバイオティクスの両方を含む飼料をターボットに与えた後、同様の結論に達した。Bogutらは、ラクトバチルス・アシドフィルス、エンテロコッカス・フェカリス、およびラクトバチルス・カゼイから作られた複合乳酸菌飼料を与えると、コイの成長が促進され、飼料変換率が向上することを発見した。飼料に複合バチルス・サチリスを添加すると、ソウギョの腸内細菌叢の構成が大幅に改善され、有益な細菌の数が増え、有害な細菌が減少する。Zhao Qianらカンジダ・アルビカンス、枯草菌、ラクトバチルス・ラムノサスによる漢方製剤の発酵は、コイの腸内細菌叢構造に重大な影響を及ぼし、最も豊富な腸内細菌叢にはラクトバチルス・ラムノサスが関与していることを発見した。孟暁鵬らは、枯草菌とビフィズス菌からなる配合飼料をバナメイエビに与え、バナメイエビの腸内細菌叢ではプロテオバクテリアが主な門であることを発見した。プロバイオティクスは、エビの腸内細菌叢の構成を大幅に変え、ビブリオの総数を減らし、病気に対する抵抗力を向上させることができる。
